Rokua on tärkeä pohjaveden muodostumisalue. Kansallispuistossa sijaitseva Pitkäjärvi on esimerkki alueelle tyypillisestä laskuojattomasta ja pohjaveden pinnan tasoa osoittavasta suppajärvestä. Pohjaveden pinnan korkeus ja siis myös suppalampien koko vaihtelee alueella suuresti. Rantakaislikon takana näkyvä hiekkatasanne kertoo pitkän aikavälin ylimmän vedenkorkeuden.